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植物多组学数据整合检测

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更新时间:2025-05-30  /
咨询工程师

信息概要

植物多组学数据整合检测是通过整合基因组、转录组、蛋白质组、代谢组等多层次数据,系统性解析植物生物学过程的技术服务。该检测能够全面揭示植物遗传调控网络、代谢通路及环境适应性机制,为品种改良、抗逆性研究、功能基因挖掘等提供科学依据。检测的重要性在于通过多维数据互补与验证,提升研究结果的准确性和可靠性,助力农业可持续发展与生物技术创新。

检测项目

  • 全基因组重测序
  • 转录组测序(RNA-Seq)
  • 小RNA测序
  • 甲基化测序(BS-Seq)
  • 蛋白质组质谱分析
  • 代谢组靶向/非靶向分析
  • 单细胞转录组测序
  • 表观遗传修饰分析
  • 基因表达差异分析
  • SNP/InDel变异检测
  • 基因共表达网络构建
  • 代谢通路富集分析
  • 蛋白互作网络预测
  • 染色体结构变异检测
  • 多组学数据联合分析
  • 基因家族进化分析
  • 启动子区功能注释
  • 非编码RNA功能预测
  • 表型-基因型关联分析
  • 环境胁迫响应基因筛选

检测范围

  • 粮食作物(水稻、小麦、玉米)
  • 经济作物(棉花、大豆、油菜)
  • 园艺植物(番茄、黄瓜、花卉)
  • 林木类(松树、杨树、桉树)
  • 药用植物(人参、灵芝、黄芪)
  • 藻类与苔藓
  • 濒危保护植物
  • 转基因植物材料
  • 野生近缘种质资源
  • 突变体库筛选样本
  • 杂交育种后代群体
  • 逆境处理实验样本
  • 病原互作研究材料
  • 组织特异性样本(根、茎、叶)
  • 不同发育阶段样本
  • 光合作用相关物种
  • 次生代谢产物富集物种
  • 能源植物(芒草、柳枝稷)
  • 模式植物(拟南芥、烟草)
  • 古植物化石DNA样本

检测方法

  • 二代测序(NGS):高通量DNA/RNA序列测定
  • 三代测序(PacBio/Nanopore):长片段基因组组装
  • 液相色谱-质谱联用(LC-MS):小分子代谢物鉴定
  • 气相色谱-质谱联用(GC-MS):挥发性化合物分析
  • 免疫共沉淀测序(ChIP-Seq):蛋白-DNA互作研究
  • 双荧光素酶报告系统:启动子活性验证
  • CRISPR/Cas9编辑验证:基因功能确证
  • 荧光定量PCR(qPCR):基因表达定量
  • Western Blot:蛋白表达水平检测
  • 酵母双杂交:蛋白互作验证
  • 代谢流分析(Metabolic Flux):通路动态解析
  • 染色体构象捕获(Hi-C):三维基因组研究
  • 原位杂交(FISH):基因定位分析
  • 同位素标记相对定量(iTRAQ):蛋白质组定量
  • 表型组成像系统:形态特征数字化采集

检测仪器

  • Illumina NovaSeq 6000测序仪
  • PacBio Sequel IIe测序系统
  • Thermo Q Exactive质谱仪
  • Agilent 7890B气相色谱仪
  • AB Sciex TripleTOF 6600
  • Bio-Rad CFX Connect荧光定量PCR仪
  • Nanopore GridION测序设备
  • Leica TCS SP8共聚焦显微镜
  • Beckman Coulter流式细胞仪
  • Qiagen BioSprint核酸提取项目合作单位
  • PerkinElmer EnVision多功能酶标仪
  • Zeiss Axio Observer显微成像系统
  • Waters ACQUITY UPLC超液相色谱
  • Illumina HiSeq X Ten测序平台
  • Miltenyi Biotec MACSQuant细胞分选仪

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